IIS6虽然已淘汰已久，但目前线上还是有许多的站点运行着，有时候因为IIS本身的调试错误或。Net库的问题，页面刷新后会提示“不是有效的 win32 应用程序”，这时候有如下排查思路可以使用：

1、检查服务器的事件查看器，定位到系统和应用程序栏目查看报错的具体原因，可能是应用程序池遇到错误退出，可能是DCOM组件出错。请根据出问题前对服务器做出的更改进行步骤还原，看看是不是更改导致组件出错。

2、检查IIS中网站的属性，查看ISAPI筛选器，看看是不是有红叉出现，如果有红叉就说明这个项没有正确加载，多数会出现在服务器安装.NET 4后没有正常加载。此时需要重新安装一下该组件，使用命令：

32 位系统
%SYSTEMROOT%\Microsoft.NET\Framework\v4.0.30727\aspnet_regiis.exe -i
64位系统
%SYSTEMROOT%\Microsoft.NET\Framework64\v4.0.30727\aspnet_regiis.exe -i

（文件夹路径请先查看一下实际目录或你安装的4.0子版本号后再替换到命令里去）

3、操作系统是64位的，IIS运行在64位模式下，需要切换到32位以适应某些32位的ISAPI。使用如下命令：

cscript %SYSTEMDRIVE%\inetpub\adminscripts\adsutil.vbs SET W3SVC/AppPools/Enable32bitAppOnWin64 1

如果要切换回64位 IIS运行模式，使用如下命令：

cscript %SYSTEMDRIVE%\inetpub\adminscripts\adsutil.vbs SET W3SVC/AppPools/Enable32bitAppOnWin64 0

参考文档：微软